В сериале Школьные духи зрители погружаются в историю школьницы Мэдди, чья жизнь трагически обрывается, но это становится лишь началом ее необычного пути. Оказавшись в промежуточном состоянии между мирами, она открывает для себя целое сообщество таких же юных призраков, вынужденных существовать в призрачной реальности. Школьные духи рассказывает о ее попытках смириться с новой реальностью, где бывшие друзья и одноклассники больше не видят и не слышат ее. Параллельно с адаптацией к непривычным правилам загробной жизни, Мэдди начинает собственное расследование, стремясь выяснить таинственные обстоятельства своей гибели и найти ответы на мучительные вопросы.