В сериале Ночной агент рассказывается о сотруднике ФБР Питере Сазерленде, чья рутинная служба на линии экстренной связи прерывается тревожным звонком. На другом конце провода оказывается Роуз Ларкин, обычная женщина, утверждающая, что на неё открыта охота и её жизни угрожает смертельная опасность. Стремясь защитить незнакомку, Питер невольно оказывается втянут в водоворот событий, которые выводят его на след масштабного заговора, уходящего в самые высокие эшелоны власти. Теперь ему предстоит не только спасти Роуз, но и раскрыть правду, рискуя всем, что у него есть.